Il clima è tipico mediterraneo, con periodi di scarse precipitazioni, alternati a spazi di tempo con: pioggia, mareggiate e venti fortissimi. I venti sempre forti da tutte le direzioni e le mareggiate, nel periodo invernale rendono incerti i collegamenti marittimi con la Sicilia.
La temperatura mite: nei mesi invernali difficilmente scende sotto i sei gradi, nel periodo estivo il termometro non supera i trentasei; rende Pantelleria un ambiente ottimo per trascorrere una vacanza sia invernale sia estiva.